Meskipun sebagian besar isi konten masih mengikuti versi Harvest Moon: Friends of Mineral Town, namun versi remake ini telah menghadirkan sejumlah perubahan dan penambahan fitur baru agar selaras dengan seri Story of Seasons.
Salah satunya adalah pilihan game mode untuk memulai game. Dalam versi SoS: FoMT terdapat dua mode yang dapat dipilih, antara lain adalah Simple dan Normal.
Disamping itu, game ini tetap mempertahankan karakter-karakter dari versi original yang rilis pada tahun 2003 lalu, meskipun seluruh desain visualnya telah di update.
Menariknya desain karakter baru tetap dikerjakan oleh ilustrator utama seri SoS: FoMT, Igusa Matsuyama, sehingga gaya visual klasik dari versi original tetap dipertahankan.
Selain upgrade visual, versi remake juga menghadirkan sejumlah perubahan pada sistem game, antara lain adalah:
- Mendukung pernikahan sesama jenis serta menambahkan dua kandidat pernikahan baru.
- Masing-masing kandidat pernikahan memiliki dua event hati romantis tambahan.
- Barang di dalam ransel kini bisa ditumpuk sehingga pengelolaan inventory menjadi lebih efisien.
- Sistem penambangan di update dengan penambahan Pitfall Hole dan Elevator.
- Tanaman kini memiliki sistem kualitas dengan ranting bintang, mulai dari satu hingga lima bintang.
- Menambahkan jenis tanaman baru, seperti kedelai dan cabai.
- Karakter utama kini dapat berjalan melewati tanaman.
- Barn dilengkapi lonceng penggembala di bagian luar bangunan untuk mengeluarkan seluruh hewan ternak secara bersamaan.
- Menambahkan beberapa jenis hewan ternak baru, seperti Strawberry Cow, Fruit Cow, Coffe Cow, Angora Rabbit, Brown Chicken, dan Alpaca.
- Kuda kini bisa ditunggangi hingga keluar dari area peternakan.
- Pilihan hewan peliharaan diperluas dengan penambahan beberapa ras anjing, kucing, penguin, dan capybara.
- Cermin di dalam rumah bisa digunakan untuk mengganti pakaian yang telah dimiliki.
- Menambahkan area baru yang terletak di antara peternakan dan penginapan.
